Las Universidades participantes han sido seleccionadas desde los países bajo la coordinación de los Centros Nacionales Tuning . La representatividad del sistema de educación superior de cada país se ha tratado de equilibrar en función del tamaño del mismo en relación con la región.

Las Universidades elegidas son de excelencia nacional en el área que representen, mostrando la capacidad de dialogar con las personas de otras instituciones que trabajen la misma área.  Tienen un peso significativo en el sistema (tamaño de la institución, trayectoria, credibilidad y autoridad académica), de tal manera que una parte importante del sistema queda representado con la participación de esta institución.